Problemas de acentuação MySQL

Estou com o seguinte problema: Um amigo teve problemas de hardware e perdeu o HD, mesmo assim consegui recuperar a pasta MySQL com arquivos .frm, então fiz o seguinte:

  • parei o serviço
  • copiei para a pasta /var/lib/mysql a pasta do banco recuperado
  • copiei também o arquivo ibdata1
  • reiniciei o serviço

As tabelas estão lá, porém quando visualizo os dados há problemas de acentuação, como: São Paulo por exemplo.

Eu tentei várias configurações do mysql.cnf e já testei:

ALTER DATABASE `minha_base` CHARSET = UTF8 COLLATE = utf8_general_ci;

e

ALTER DATABASE `minha_base` CHARSET = Latin1 COLLATE = latin1_swedish_ci;

Alguém poderia me dizer como posso corrigir isso ? Um detalhe que pode ter originado o erro é que ele usava Windows Server 2013 e eu estou fazendo isso no Linux Mint.