Na linha 3 o número está valendo -4, que em binário equivale a 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1100. (obtido pelo complemento de 2 do número 4)
Em seguida os bits são deslocados em uma posição e, além disso, como está usando o operador >>>, o bit de sinal (mais à esquerda) é preenchido com 0, resultando no número binário 0111 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1110, que equivale ao número 2147483646 em base decimal.
Então a representação binária de -4 é obtido pelo complemento de dois do número 4.
O complemento de dois é feito tirando o complemento (inversão de todos os bits) de um número e somando 1 a este resultado.
Exemplo usando o número de 32 bits (que é o caso do tipo int):
0000 0000 0000 0000 0000 0000 0000 0100 // 4 em binário
1111 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1011 // complemento
1 + // soma 1
1111 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1100 // -4 em binário
O bit mais significativo representa o sinal negativo, ou seja, se estiver em 1 o número é negativo, caso contrário o número é positivo.
Obs.: O complemento de dois é usado para compensar o 0. Pois a faixa positiva vai de 0 a 2147483647 (considerando número de 32 bits) e, como não existe o -0, a faixa negativa vai de -1 a -2147483648. Por isso é feita aquela soma no complemento.