Duvida Glassfish no linux

Prezados

Tenho uma aplicação web rodando em Linux Fedora 10 e Glassfish. Essa minha aplicação deveria gravar uns documentos pdf em determinado diretório no linux porém a mesma não faz isso, já tentei todos os tipos de permissão mais nada ainda. Alguém sabe me dizer se existe algum parametro de configuração do glassfish para liberar essa gravação?

Obrigado.

Abs