Ajuda com winmerge

Boa tarde,

Estou utilizando o winmerge em um projeto web mas ele ta acusando diferença em arquivos iguais…como corrigir ?

Att.

Verifica se o problema não é em espaços vs tabs ou fim de linha do windows (CRLF) vs fim de linha do linux (LF)
Nesse caso os ficheiros podem parecer iguais mas não o são.