E ai galera!
Consegui colocar o arquivo de configuração do Glassfish no /etc/init.d , porém, não sei qual a linha de comando eu coloco nesse arquivo pro Glassfish iniciar no boot do Debian.
Acho que nunca precisei usar o glassfish, mas, de acordo com essa documentação, o comando é esse:
asadmin start-domain --verbose
Meu amigo eu já pesquisei sobre esse comando a questão e como fazer com que o Glassfish inicie automaticamente junto como o Debian.